云南省中西医结合慢病防治重点实验室（原云南省中医药学分子生物学重点实验室）依托云南中医药大学与360环球在线注册共建。实验室聚焦中西医结合防治常见慢性病、内分泌代谢性疾病、脑病、风湿免疫病等的机理与临床开展基础和应用研究。实验室设置研究方向5个，下设PI团队，固定成员87人，高级职称人员57人，博士43人，省级以上人才16人。实验室占地2000余平方米，拥有科研设备价值5000余万元，实验平台面向各高校、医院及科研院所等开放共享。依托重点实验室建设有2个省级创新团队、3个云南省院士（专家）工作站及10余个基层专家工作站，支撑学校中医学、中西医结合、中药学学科和博士点建设，成为中医药“本-硕-博”实践创新能力培养基地。近3年在研国家级、省级科研项目共计104项，科研经费总计3195万元，发表论文71篇，其中SCI论文31篇，编写专著3部，获得国家发明专利7件。
实验室以基础研究融合临床应用及产业转化，创办了新型研发机构——云南云岭药用资源创新研究院，研究院以重点实验室为牵头，整合深圳大学药学院、中山大学生命科学学院、山东省药学科学院生物药物研究所、华南理工大学华南理工大学食品科学与工程学院、昆明医科大学第一附属医院、昆明市中医院等省内外高层次医药学科研机构、医院和食品生产企业，构建新型“科研创新与转化应用中心”。聚焦云南省优势特色药用植物，将其应用于药食同源功能食品研发、名优中成药二次开发、名老中医有效验方开发为医疗机构制剂等方面进行创新性应用。形成中医药特色鲜明的“产学研”一体化平台，推动中医药科技创新，助力云南省打造生物医药和大健康产业新业态。